Друга ліга в наступному сезоні може поповнитися відразу сім’ю аматорськими клубами. Процедуру атестації для участі в змаганнях другої ліги ПФЛ у сезоні 2016/17 проходять «Балкани» Одеська область, «Перлина» Одеса, «Кривбас», запорізький «Россо Неро» (перейменований в «Металург»), «Рух» Винники, «Нива -В »Вінниця та« Поділля ».
На даний момент у другій лізі виступає 14 команд. Минулого літа дивізіон поповнили шість аматорських клубів: «Колос», «Верес», «Інгулець», «Арсенал-Київ», «Мир» і «Барса».